2009年我國將繼續履行加入世界貿易組織的關稅減讓承諾，進一步降低鮮草莓等5種商品的進口關稅；繼續對小麥、玉米、稻谷和大米、糖、羊毛、毛條、棉花等7種農產品和尿素、復合肥、磷酸氫二銨等3種化肥實施關稅配額管理，其中，對關稅配額外進口一定數量的棉花繼續實施滑準稅，稅率維持不變；對尿素、復合肥、磷酸氫二銨繼續實施1%的暫定配額稅率；繼續對凍雞等55種商品實施從量稅或復合稅，并調低11種膠卷的從量稅稅率。調整后，我國關稅總水平仍為9.8%，其中，農產品平均稅率為15.2%，工業品平均稅率為8.9%。
為有效發揮關稅政策的經濟杠桿作用，推進經濟結構調整和發展方式轉變，進一步擴大先進技術、設備、關鍵零部件進口，滿足國內經濟社會發展需要，促進資源節約和環境保護，提高人民生活水平，明年我國將對670多種商品實施較低的進口暫定稅率，主要包括煤炭、燃料油、石料等資源能源類產品，氨水、環氧樹脂、液晶顯示板用偏振片、空調用無級變速壓縮機、大型清障車底盤等重要原材料和關鍵零部件，噴氣織機、自動絡筒機、大馬力拖拉機、大型收割機等先進工農業設備，疫苗、無障礙升降機、陶瓷等與公共衛生相關的產品及部分家居生活用品等。繼續對進口天然橡膠實施選擇稅。同時，為進一步限制高能耗、高污染產品出口，明年將繼續以暫定稅率的方式對焦炭、原油、金屬礦砂、鐵合金、鋼坯等產品征收出口關稅，繼續對復合肥等化肥及其原料等征收特別出口關稅，并降低了稅率。此外，繼續對尿素、磷酸銨、重過磷酸鈣等化肥征收季節性出口關稅，在用肥淡季出口關稅繼續采取差價稅形式。
為擴大雙邊、多邊經貿合作，促進區域經濟發展，我國將依據中國-東盟、中國-智利、中國-巴基斯坦、中國-新西蘭、中國-新加坡等自由貿易協定以及《亞太貿易協定》，對原產于東盟十國、智利、巴基斯坦、新西蘭、新加坡、韓國、印度、斯里蘭卡、孟加拉等國家的部分進口商品實施比最惠國稅率更優惠的協定稅率。在內地與香港、澳門更緊密經貿關系安排框架下，繼續對原產于港澳地區且已制定原產地優惠標準的產品實施零關稅。繼續對原產于老撾等東南亞4國、蘇丹等非洲31國、也門等6國，共41個最不發達國家的部分商品實施特惠稅率。
為進一步落實有關稅收和產業政策，適應科學技術進步和加強進出口管理的需要，在符合世界海關組織有關列目原則的前提下，對進出口稅則中部分稅目進行了調整，我國2009年版進出口稅則稅目總數由2008年的7758個增至7868個。
